接下来的一个多月，朱西瑞在特训营开始了他的宇航员训练。
载人航天首要要解决三方面的问题：1．乘宇宙飞船遨游太空的过程中，在那种特定的狭小的环境中，要学会在失重条件下吃、喝、拉、撒、睡；2．要学会操纵、控制飞行器，学会使用舱内的仪器设备，并能在其中做科学实验。对地观察、遥测和通讯等，能够及时地发现故障并排除故障；3．临危不惧，在危险的情况下，能够逃逸救生。非正常返回的情况下，不管是降落在江、河、湖、海，或沙漠、戈壁、高山、峡谷、热带丛林、茫茫林海雪原的高寒地带，都能够生存，能够及时求救和自救。
训练总的来说分三个阶段进行，基础理论训练阶段、航天专业技术训练阶段、飞行程序与任务模拟训练阶段。
首先进行的是专业基础理论训练，学习内容包括宇宙、大气、天文、气象、地球物理、空气动力学、火箭与飞船设计原理、飞船系统及部件结构、导航及控制、通讯、遥测及遥控、数学、计算机以及外语等航天所需的理论知识。此外，还有航天医学和生理学等内容。
接着是体能训练，为了迎接严酷的太空环境的挑战，锻炼的科目是多样性的，以耐力为主的长跑、游泳、爬山等；以力量为主的负重、仰卧起坐等；以灵活性为主的体操、固定滚轮、旋梯、弹性跳跃网、秋千、转椅、浪木等以及锻炼心肺功能的跑台，自行车功量计等有针对性的运动。
最为让朱西瑞受不了的是特因耐力与适应性训练，它包括超重训练、前庭功能训练、低压缺氧、高／低温、振动和噪声环境训练等。
火箭起飞时，航天员将会遇到806GS的加速度，这样大的加速度，人体无论如何是耐受不了的。工程上把它分解，采用三级运载火箭，使得每级不超过5G，每级持续时间100秒至200秒左右，飞船返回时，重力加速度为5至9G，持续200秒左右，而人的耐受限度，纵向3至4G；横向（从胸到背方向）可达7至8G，持续时间可到30秒，朱西瑞没经过超重力训练，第一次训练才9秒多就失去了知觉。
超重耐力训练是在离心机上周期性的训练和适应，这个训练折腾的他死去活来，总算熬过去了，接下来是失重训练。
飞船飞离地心引力之后，处于无重力环境下，由于失重，身轻如燕，航天员和其他物品如不被束缚，就飘来飘去，虽然看上去很好玩，但会感到有点头晕脑胀，操作不便，甚至有时定向能力发生困难。这样，就很难在太空生活、工作和执行特殊的飞行任务。
因此，必须在地球重力环境下，制造失重环境，加大失重适应性的训练。失重环境是靠高性能失重飞机飞抛物线获得的。每作一次抛物线飞行可获得20秒至30秒失重时间，多次连续抛物线飞行，在飞机作一次起降飞行时间内累计可获得10至40分钟的失重时间。
